病原体在体内面临变化的微环境，但是合适的实验体系和分析工具来解析3D组织环境怎样影响病原体的传播是缺乏的。近日，国际著名学术期刊Nature Communication上刊登的德国海德堡大学附属医院的研究人员的论文解决了这一问题。
研究人员研发了一种通过实验和计算研究病原体在类似组织的3D培养物(INSPECT-3D)中传播的综合方法，将病原体复制的定量和成像结合起来，以研究单细胞和细胞群体的动态。他们应用INSPECT-3D分析了HIV-1在以胶原作为组织样3D支架的人类CD4 T淋巴细胞之间的传播。通过数学分析，将对病毒复制、传染性、扩散、细胞运动和相互作用的测量结合成一个综合的空间感染模型，以估计控制HIV-1传播的参数。这表明，环境限制了无细胞病毒的感染，但却促进了与细胞相关的HIV-1的传播。实验证实，细胞运动和密度是决定HIV-1在3D培养物中传播的有效性和方式的重要因素。
INSPECT-3D在检测3D胶原中病原体传播的工作流程、实验系统和种群分析
总之，INSPECT-3D是一种适用于研究病原体在3D培养物中传播定量时间分辨分析的方法。
本期编辑：乌龟