甲型流感病毒为常见流感病毒，甲型流感病毒最容易发生变异，甲型流感病毒的亚型则被人们称为“禽流感”，禽流感(Bird Flu）是由禽流感病毒引起的一种急性传染病，病毒基因变异后能够感染人类，感染后的症状主要表现为高热、咳嗽、流涕、肌痛等，多数伴有严重的肺炎，严重者心、肾等多种脏器衰竭导致死亡，病死率很高。
水禽和滨鸟被认为是甲型流感的储存库，但是最近发表在Nature上的一篇文章则在蝙蝠中鉴定出了新型甲型流感病毒。该类蝙蝠甲型流感病毒包膜糖蛋白，血细胞凝集素，尽管其与常规血凝素具有高度序列和结构同源性，但不与典型的甲型流感病毒受体，唾液酸或任何其他聚糖结合。
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