近日，广西大学陈樱副教授等通过对广西壮族自治区内犬类获得的16种流感病毒的完整基因组进行了测序，结果发现猪流感病毒H1N1已经传播给狗，并在狗体内与其他病毒基因发生重组，狗体内的流感病毒亚型正在增多。这一研究成果发表在美国微生物杂志《mBio》上。
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流感的主要动物宿主是野生鸟类，家禽，猪，马和犬等。这些动物宿主可以作为流感的混合容器，病毒之间进行重组，形成遗传多样性。当重组病毒从动物进入人体时由于人们之前未曾接触过这种病毒，因此很容易就会发生流感流行。例如。2013年爆发的H7N9病毒疫情，就是由三种病毒重组形成，并突破跨种传播进入人体。
H7N9重组示意图
禽类和猪是导致流感病毒基因产生多样性的主要宿主，而狗和马携带的甲型流感病毒类型较少，并且几乎不传染人。此前研究发现，在狗之间流行的犬甲型流感病毒（canine influenza viruses，CIV）类型主要为H3N8和H3N2。在这项新研究中，研究人员对2013-2015年期间在中国南部（广西壮族自治区）犬类获得的16种流感病毒的完整基因组进行了测序。结果发现狗中的犬流感进化已变得复杂，有两种猪H1N1流感已传播至狗内，而且其中一种来自猪的H1N1病毒起源于禽类（基因组分析表明传入的猪流感谱系片段来源：北美三联重组H3N2，欧亚禽类H1N1和大流行H1N1）。
此外，研究还表明猪源H1N1病毒在犬科动物中传播，并与在亚洲犬中特有的CIV-H3N2病毒重组，产生三种新的重配CIV基因型：H1N1r，H1N2r和H3N2r。研究中发现的新H1N1病毒来自猪并且是禽源性的，狗体内的流感病毒具备了多样性，病毒基因可以相互组合，这可能给人类造成风险。未来的研究将会进一步分析病毒，并利用人类血清评估人类是否具有针对犬H1N1流感的免疫力。
犬内新型重组病毒示意图
目前还没有人感染这些狗流感病毒的案例。如果一旦这一重组病毒突破物种屏障感染人体，而我们对这些病毒没有免疫力的话，未来流感可能会来自于我们人类最好的伙伴——狗。研究人员和相关部门需要进行相应的监测。广西大学动物科技学院陈樱副教授，美国西奈山医学院Nídia S. Trovão和王国俊为共同第一作者，美国西奈山医学院Adolfo García-Sastre教授为通讯作者。
人畜共患流感传播示意图，新犬流感病毒对人存在威胁
原文摘要：
The capacity of influenza A viruses (IAVs) to host jump from animal reservoir species to humans presents an ongoing pandemic threat. Birds and swine are considered major reservoirs of viral genetic diversity, whereas equines and canines have historically been restricted to one or two stable IAV lineages with no transmission to humans. Here, by sequencing the complete genomes of 16 IAVs obtained from canines in southern China (Guangxi Zhuang Autonomous Region [Guangxi]) in 2013 to 2015, we demonstrate that the evolution of canine influenza viruses (CIVs) in Asian dogs is increasingly complex, presenting a potential threat to humans. First, two reassortant H1N1 virus genotypes were introduced independently from swine into canines in Guangxi, including one genotype associated with a zoonotic infection. The genomes contain segments from three lineages that circulate in swine in China: North American triple reassortant H3N2, Eurasian avian-like H1N1, and pandemic H1N1. Furthermore, the swine-origin H1N1 viruses have transmitted onward in canines and reassorted with the CIV-H3N2 viruses that circulate endemically in Asian dogs, producing three novel reassortant CIV genotypes (H1N1r, H1N2r, and H3N2r [r stands for reassortant]). CIVs from this study were collected primarily from pet dogs presenting with respiratory symptoms at veterinary clinics, but dogs in Guangxi are also raised for meat, and street dogs roam freely, creating a more complex ecosystem for CIV transmission. Further surveillance is greatly needed to understand the full genetic diversity of CIV in southern China, the nature of viral emergence and persistence in the region’s diverse canine populations, and the zoonotic risk as the viruses continue to evolve.
原文地址：http://mbio.asm.org/content/9/3/e00909-18
编辑：ipsvirus
本文转自“病毒学界”。
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