精准诊断新模式丨NGS大panel检测:质控体系及问题讨论

世和基因卫星会上,应建明老师带来的“精准诊断新模式丨NGS大panel检测:质控体系及问题讨论”专题就对这些问题进行了解析,并根据世和已积累的15万临床大数据,给出了突变入库的标注和过滤的标准:


精准诊断新模式丨NGS大panel检测:质控体系及问题讨论

细心的小伙伴已经发现,应建明老师就是燃石卫星会上“中国肿瘤NGS第一证的注册之路”的报告嘉宾,燃石和世和已然是“亦敌亦友”的关系。今天在世和基因卫星会上,跟大家分享精准诊疗模式下,NGS大panel检测的质控体系问题。


精准诊断新模式丨NGS大panel检测:质控体系及问题讨论

同样道理,FDA已经批准的NGS检测:Oncomine Dx Target Test ➝ Praxis Extended RAS Panel ➝ MSK-IMPACT ➝ FoundationOne CDx,NGS大panel才是趋势。


精准诊断新模式丨NGS大panel检测:质控体系及问题讨论

国内NGS检测试剂盒,除了已经获批的燃石和诺禾的试剂盒以外,世和的试剂盒将会成为第三个,只是非常可惜,在CSCO会议期间并没有能批准下来(应该也就这几天能下来),世和检测的是肺癌6基因(与燃石4基因和诺和6基因不完全一样),灵敏度达到1%(在获批试剂盒中灵敏度是最高的)。


精准诊断新模式丨NGS大panel检测:质控体系及问题讨论

大panel检测才是未来的趋势,分享世和的425基因panel所能检测的内容。


精准诊断新模式丨NGS大panel检测:质控体系及问题讨论

(425panel)NGS检测的实验流程:样本收集-DNA提取-文库构建-杂交富集-上机测序。


精准诊断新模式丨NGS大panel检测:质控体系及问题讨论

(425panel)NGS生信分析流程:测序Run质控-Reads质控-样本质控-公共数据库+自建数据库。


精准诊断新模式丨NGS大panel检测:质控体系及问题讨论

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精准医疗的发展离不开大数据,医疗组学大数据和医学的结合才是精准医疗的核心。而做到这一点,显然并不容易。


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