3 年发十余篇 SCI 大神:「提高数据质量,是高效发论文的根本」



在这样一个科研快速增长的年代,SCI 论文似乎已经成了我们科研人员的「安身立命」之本了。如同下面的环形图显示的一样,对于科研人员来说,数据是论文的源头,是非常宝贵的财富和资源。


3 年发十余篇 SCI 大神:「提高数据质量,是高效发论文的根本」


当我们费劲拿到自己的数据之后,满怀欣喜的打开数据时,是否有考虑过以下几个问题?(以临床常见的数据为例)


  1. 我的数据有多少变量,有多少个研究对象?

  2. 数据结构整齐吗?

  3. 数据中每个变量都是什么类型的?分类变量?连续变量?还是计数的?

  4. 变量中有缺失值吗?缺失值是以什么符号代替的?缺失值比例是多少?

  5. 对于缺失值,我是直接踢除还是进行插补?

  6. 有异常值和重复值吗?

  7. 常用的连续型变量是正态分布的吗?不是该咋办?进行数据转换?还是直接非参检验?

  8. 会不会有字符掺杂在连续型变量中?会不会有中文和英文混在一起?

  9. 我需不需要将这个数据和其他数据进行匹配整合?

  10. 我的目标数据在这个数据集中吗?在的话,我该如何把它们单独「拎」出来?




上述的「数据十连问」,总结起来就是一个问题,「我的数据干净吗」?这些问题提醒了我们:不要一拿到数据就上手分析,要先判断下这些数据是否适合分析。否则,十有八九得到的结果是不准确或者完全错误的,既浪费了时间又降低了论文的质量。


举个最简单的例子,假如数据是偏态分布的,用最常用的 t 检验就是错误的,会直接被 reviewer 质问。再比如,在进行回归分析时,如果没有合理的处理分类变量及其参照水平,也直接影响最后结果的准确性。


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然而现实科研工作中,部分人就抱着侥幸心理,想「划水」过。但常在河边走,总是会湿鞋,划水划得多了,总有翻船的一天。尤其对于想发高分 SCI 论文的童鞋来说,划水是万万划不过去的。


据我所知,一些高 IF 的期刊,都配有专门的统计 reviewer,一些「障眼法」基本逃不过他们的法眼。所以,说一千道一万,数据的质量决定了结果的好坏,一定要先正确整理原始数据,即进行「数据清洗」,然后再进行数据分析。


数据清洗对数据分析师是一个非常常见也十分重要的工作。而对于从事医学科研的我们,尤其是战斗在科研一线的研究僧同志来说,并非数据专业出身,对「数据清洗」一词估计会比较陌生。实际上,我们几乎每次研究都会涉及到缺失值、异常值等的处理问题,而这些都是数据清洗的内容。


简单来说,所谓的「数据清洗」,就是将我们拿到的原始数据,整理成可以拿来进行统计分析和可视化的数据。这里面涉及的东西非常多,是一个比较繁琐庞杂的工作。


如下图所示,从拿到数据到最后拿到结果,一半以上的时间都花费在数据清洗阶段了。(Dasu T, Johnson T (2003). Exploratory Data Mining and Data Cleaning. Wiley-IEEE.)


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如何快速、高效且正确地进行数据清洗,降低我们的时间成本呢?个人的经验是:掌握一门计算机语言,熟悉一套完整的数据清洗流程。


我在读硕士时,专业是流行病与卫生统计学,不做实验(曾经做过一年,证实了一个问题,我不适合 bench 工作),不上临床,每天的主要工作就是接触大量的数据,并且想办法处理并分析它们。这些数据有些是我们自己试验得到的,有些来自于公共数据库。


刚开始用 EXCEL 和 SPSS 进行数据处理,走了非常多的弯路,实在是「想死」的心都有了。后来痛下决心,花几个月时间学习了 R 语言,真的感觉「柳暗花明又一村」了。


R 语言是现在非常流行的统计语言,在各大 SCI 牛刊也是越来越频繁出现。甚至有人说,会用 R 语言,已经是现在搞科研的标配了。


这话还真不夸张。R 语言可以说是专为统计而生的计算机语言,相比其它统计软件或计算机语言,有着得天独厚的优势。比如,它有一整套完整的数据清洗流程,几乎涵盖所有可及的统计学方法,精美的统计绘图系统等。


我自己在掌握 R 语言后,三年内,以相对快的速度发表了十余篇 SCI,且全部为第一作者或并列一作,总影响因子超过 60。虽然有人说,你就会灌水,可是我想说的是,即便是灌水,我们也要有策略的灌水,往高分杂志上灌水。


说到这,可能有同学就开始动心,像我当初一样痛下决心学习 R 语言了。毕竟学习 R 语言,可以帮助我们更好的发论文,而论文是大家都想要的东西。


现在市面上 R 语言的课程很多,但是大多不够系统,或太过庞杂不够聚焦。这次,我将自己以往数据清洗的经验,依托于 R 语言,在丁香公开课上呈现给大家。


这门课不仅让大家能够从基础做起,熟悉和掌握 R 语言,还能掌握完整的数据清洗方法。


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一门课,并不能解决大家的所有问题。但我希望通过这门课程,给大家分析一些正确统计的观念和技巧,正所谓「授之以鱼,不如授之以渔」。


衷心希望它能给大家带来帮助,提高大家的科研效率。



责任编辑:袁蕾

题图来源:站酷海洛Plus



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